Las auditorías Internas al SINCLA se realizan por procesos bajo un enfoque integrado en la autoevaluación institucional; tienen por objetivo verificar el correcto funcionamiento de los procesos de acuerdo a los criterios establecidos identificando las fortalezas, debilidades, observaciones, aspectos por mejorar y no conformidades, todo ello, mediante la aplicación de la norma NTC ISO 19011: 2012 que establece las directrices para la auditoría de los Sistemas de Gestión.